― RAD-seq 解析 ―
【RAD-seq 解析】stacks ― denovo-map.pl 編 ― - 研究メモ (hatenablog.com)
【RAD-seq】stacks のパイプラインプログラムが動かない問題の解決方策 - 研究メモ (hatenablog.com)
【RAD-seq 解析】ipyrad、やってみた - 研究メモ (hatenablog.com)
― SNP 解析関連 ―
【SNP 解析】vcf ファイルのフィルタリング by Tassel - 研究メモ (hatenablog.com)
【SNP 解析】Neighbor-Net の描画 - 研究メモ (hatenablog.com)
【SNP 解析】STRUCTUREのきれいな図作成への道 by R - 研究メモ (hatenablog.com)
Structure解析とその周辺ソフトウェアの使い方（注意：CLUMPP実行までで終わっています） - 研究メモ (hatenablog.com)
SNPデータでML系統樹作成 - 研究メモ (hatenablog.com)
Rを用いてPCA解析を行う方法 - 研究メモ (hatenablog.com)
Rを用いてDAPC解析を行う方法 - 研究メモ (hatenablog.com)
― 腸内細菌叢解析関連 ―
【1】16S rRNA 菌叢解析やってみた（データのインポート～DADA2 によるデノイジング by Qiime2） - Gai memo
【2】16S rRNA 菌叢解析やってみた（メタデータ作成～菌叢棒グラフ作成まで） - Gai memo
― ゲノムアセンブリ関連 ―
【de novo ゲノムアセンブリ】SOAPdenovoを使ってみた - 研究メモ (hatenablog.com)
ショットガンシーケンスによるゲノム断片を用いてミトコンドリアゲノムのアセンブリをやってみた - 研究メモ (hatenablog.com)
ぐだぐだde novoゲノムアセンブリ日記 - 研究メモ (hatenablog.com)
― その他遺伝子解析関連 ―
集団遺伝学的解析用ソフトウェア「Arlequin」 の使い方 - Gai memo (hatenablog.com)
Arlequin for Linux の使い方 - Gai memo (hatenablog.com)
ハプロタイプネットワークの描画 by Network - Gai memo (hatenablog.com)
ultrametric treeを作ってみよう@RStudio - 研究メモ (hatenablog.com)
おまけ Linux版BEASTを動かす方法 - 研究メモ (hatenablog.com)
Linux版BEASTでTreeAnnotatorを動かす方法 - 研究メモ (hatenablog.com)
