研究メモブログの目次

2023-07-01から1ヶ月間の記事一覧

【3】16S rRNA 菌叢解析やってみた(visualization of taxonomy abundance, α,β-diversity by MicrobiotaProcess)

こんにちは~。ガイです。 前回、前々回で生データ処理~分類群情報とその頻度を取得するところまで終わりました。ここからはいよいよ様々な指標の可視化に入っていきます。 ブログを見ている人にはお察しかもしれませんが、わたしはR スキルがあまりありま…

【2】16S rRNA 菌叢解析やってみた(メタデータ作成~菌叢棒グラフ作成まで)

こんにちは~。ガイです。前回の続きを書いていこうと思います。 前回までで、Qiime2 conceptual-overview でいうところのFeature Table とRepresentative Sequences が手に入りました。ここからようやく解析らしい解析に入っていけます。本当はconceptual-o…

【1】16S rRNA 菌叢解析やってみた(データのインポート~DADA2 によるデノイジング by Qiime2)

こんにちは~。ガイです。生きてます。博士課程の荒波に揉まれて瀕死になっていました。現在D3なのですが、なんとこの春から研究テーマが変わりました。その辺りからも崖っぷち度合いはお察しいただけると思います。大人の事情でふたたびバイオインフォっぽ…