2023-01-01から1年間の記事一覧
こんにちは~。ガイです。 研究室見学に行く際の質問事項を自分用にまとめたので投下します。ソースのブログも載せておきます。 これを実践したところで本当のところは入ってみないとわからないのですが。 失敗する方法はいくらでもわかるのに成功する方法は…
こんにちは~、ガイです。今回はR グラフ描画の備忘録です。ChatGPT と相談しながらfor 文を使ってなるべくデータごとに詳細を変更しないで済むようにするスクリプトを書きました。 たとえば、以下の共通の操作の項目のところにインプットデータ例を示してい…
こんにちは~。ガイです。 前回、前々回で生データ処理~分類群情報とその頻度を取得するところまで終わりました。ここからはいよいよ様々な指標の可視化に入っていきます。 ブログを見ている人にはお察しかもしれませんが、わたしはR スキルがあまりありま…
こんにちは~。ガイです。前回の続きを書いていこうと思います。 前回までで、Qiime2 conceptual-overview でいうところのFeature Table とRepresentative Sequences が手に入りました。ここからようやく解析らしい解析に入っていけます。本当はconceptual-o…
こんにちは~。ガイです。生きてます。博士課程の荒波に揉まれて瀕死になっていました。現在D3なのですが、なんとこの春から研究テーマが変わりました。その辺りからも崖っぷち度合いはお察しいただけると思います。大人の事情でふたたびバイオインフォっぽ…