SNPデータ入りのvcfファイルからPCAをする方法を教わったのでメモ。デモデータは202座位33個体、参照URLの閲覧日は本記事を作成した2020年12月19日現在のものとします。 PCA とは →A Tutorial on Principal Component Analysis pca.dvi (cmu.edu)

Rを使ってSNPデータ入りのvcfファイルからDAPCをする方法を教わったのでメモ。 解析にはRstudioを使っています。 デモデータは202座位33個体、参照URLの閲覧日は本記事を作成した2020年12月19日現在のものとします。 ちなみに、DAPCとPCAのインプットは各遺…