研究メモブログの目次

2020-12-22から1日間の記事一覧

解析中だけどログアウトしたいときに便利なコマンド@Linux

解析中だけど帰りたい!サーバー上で解析中だけどデータ通信が不安定で解析中に途切れそう!なときに便利なコマンドがnohupとdisownです。 具体的にこの二つが何をしているのかはこのページを見るとわかります。 HUPシグナルとnohupとdisownとバック/フォア…

ultrametric treeを作ってみよう@RStudio

はじめに注意ですが、何かの解析のインプットとして用いる場合、同じUltrametricTreeでも、作り方によってその後の解析の結果の精度が変わるようです(例:GMYC解析)。したがって、先行研究を見て、どんな方法でultrametric treeを作っているのかを確認した…

おまけ Linux版BEASTを動かす方法

Linux 版BEASTもちょっとは無理が利く印象(体感です)。 使い方は以下。

Linux版BEASTでTreeAnnotatorを動かす方法

インターフェース付きBEASTのTree annotator はMCMCの回数を増やすと動いてくれないのでLinux版でやってみた。 Linux版BEASTをインストール Linux版BEASTの簡単なチュートリアルはこのサイトへ Introduction to BEAST - Bioinformatics Tutorials (bioinform…